代用燃料汽车的税收抵免方法与其他类型的新能源汽车有所不同，其税收抵免是代用燃料汽车与对比车型的差价的一个百分比。符合条件的代用燃料汽车对应的比例有50%和80%两个档次，而对于混合燃料汽车来说，相应比例分别为70%和90%。

符合条件的代用燃料汽车税收抵免

    无论是购买新的原装代用燃料汽车，还是使用代用燃料的改装车，均可获得税收抵免。符合条件的代用燃料是指天然气、液化石油气、氢和至少搀兑85%甲醇的燃料。车辆必须是2006年1月1日（含此日）之后开始使用的代用燃料汽车。车辆制造商必须按照通知2006-54规定的程序，向国内税务局（IRS）证明其车辆符合申请代用燃料税收抵免的条件，并确认车辆可获得的税收抵免额度。通过IRS QAFMV可了解当前符合条件的代用燃料汽车及其抵免额度。表8910 (PDF 267 KB)包含附近说明，对于申请者是必需的。该项税收抵免于2010年12月31日终止。

新的符合条件的代用燃料汽车税收抵免额度

    等于在年度纳税期间投入使用的任何符合条件的代用燃料汽车的新增成本的一个相应的百分比。

    任何新的符合条件的代用燃料汽车适用的抵免差价的百分比是：50%；

    如果满足以下两个条件中的任何一个，则抵免的百分比是：50%+30%

（1）已依照《清洁空气法》获得一个排放审核证书，或者超过《清洁空气法》规定的适用该品牌的本车型年的最严标准（而非零排放标准）。

（2）已获得一个关于该车与可能在加州出售或出租的车辆满足同样条件的认证，并满足或超过加州规定的适合该品牌的最严标准（而非零排放标准）。

新增成本：

    代用燃料汽车的厂家推荐售价超过同车型汽油车或柴油车的厂家推荐售价的部分

基于车总重，设置了税收抵免的上限

混合燃料汽车税收抵免额度

   对混合燃料汽车实行的是减额税收抵免（reduced credit）。例如，对于混合比例为75：25的混合燃料汽车，其额度为全额税收抵免（full credit）的70%。其中，全额税收抵免额的算法与其他代用燃料汽车税收抵免额的算法一致。